Математическая биофизика клетки

Автор(ы):Иваницкий Г. Р.
06.10.2007
Год изд.:1978
Описание: В книге рассмотрены математическое моделирование ферментативных реакций и полиферментных систем, модели возбудимых мембран и тканей, моделирование и реконструкция различных внутриклеточных структур. Содержится теоретический и экспериментальный материал, основанный на методах электронной микроскопии, когерентной оптики, а также на качественных методах анализа в приложении к проблемам формальной химической кинетики, ионных токов мембран, распространения волн возбуждения, сокращения сердечной мышцы, машинного анализа биоструктур.
Оглавление:
Математическая биофизика клетки — обложка книги. Обложка книги.
ОТ АВТОРОВ [3]
ВВЕДЕНИЕ [4]
1. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ БИОХИМИЧЕСКИХ СИСТЕМ
  Глава первая. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ НЕПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ [14]
    1.1. Два направления в моделировании ферментативных реакций [14]
    1.2. Ферменты — белковые катализаторы и регуляторы [16]
    1.3. Метод графов [21]
    1.4. Модели реакций, катализируемых одноцентровыми ферментами [25]
    1.5. Модели реакций, катализируемые олигомерными ферментами [30]
    1.6. Свойства реакции S(?)(???)S(?) [37]
    1.7. Свойства двухсубстратной реакции S1+S2(???)S3+S4 [44]
  Глава вторая. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРОТОЧНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ [46]
    2.1 Общие методы исследования системы обыкновенных дифференциальных уравнений второго порядка [46]
    2.2. Модель открытой реакции S1(?)S2 с субстратным угнетением [52]
    2.3. Модель двухсубстратной реакции с субстратным угнетением [59]
    2.4. Динамика открытых реакций, катализируемых олигомерными ферментами [64]
    2.5. Разнообразие поведения открытых ферментативных реакций [68]
    2.6. Эквивалентные математические и кинетические модели [73]
    2.7. Эффект депонирования [76]
  Глава третья. МОДЕЛИРОВАНИЕ ПОЛИФЕРМЕНТНЫХ СИСТЕМ [77]
    3.1. Полиферментные системы и их модели [77]
    3.2. Уровни функциональной организации полиферментных систем [79]
    3.3. Простая модель стехиометрической структуры энергетического метаболизма [85]
    3.4. Два класса аллостерических регуляторных связей, контролирующих энергетический метаболизм [92]
2. МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ ВОЗБУДИМЫХ МЕМБРАН
  Глава четвертая. КАЧЕСТВЕННЫЕ МЕТОДЫ В ИССЛЕДОВАНИИ МОДЕЛЕЙ МЕМБРАН [102]
    4.1. Построение уравнений второго порядка для моделей Ходжкина—Хаксли и Нобла. Точность аппроксимации [103]
    4.2. Фазовые портреты систем второго порядка [108]
    4.3. Исследование основных режимов мембраны аксона кальмара с помощью качественных методов [109]
    4.4. Исследование основных режимов мембраны волокна Пуркинье сердца с помощью качественных методов [115]
    4.5. Математические детали асимптотического сведения уравнений Ходжкина — Хаксли к системе второго порядка Н—Н2 [119]
  Глава пятая. БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ВЕЩЕСТВА, ИОННЫЕ ТОКИ И ЭЛЕКТРОФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ МЕМБРАН [122]
    5.1. Построение фазового портрета мембраны по записям ионных токов при фиксации потенциала.„„
    5.2. Техника анализа мембран по записям ионных токов [125]
    5.3. Фазовые портреты мембран сердечной, нервной и мышечной клеток [129]
    5.4. Анализ действия веществ на мембраны [131]
    5.5. Предсказание электрофизиологических эффектов с помощью качественных методов [134]
    5.6. Границы применимости анализа мембран по фазовому портрету [137]
    5.7. Оценка на математических моделях мембран точности построения фазового портрета по записям ионных токов [138]
3. ВОЗБУДИМЫЕ СРЕДЫ. ВОЛНЫ И АВТОВОЛНОВЫЕ ПРОЦЕССЫ
  Глава шестая. РЕВЕРБЕРАТОР - ИСТОЧНИК СПИРАЛЬНЫХ ВОЛН В ВОЗБУДИМЫХ СРЕДАХ [141]
    6.1. Автоволновые процессы в возбудимых средах [141]
    6.2. Распространение волн в однородной среде. Спиральная волна, вращающаяся вокруг отверстия, и ревербератор [144]
    6.3. Возникновение ревербератора в простейшей неоднородной среде [147]
    6.4. Ревербератор в более детальных моделях [152]
    6.5. Свойства ревербератора как источника волн. Размножение ревербераторов в неоднородной среде. Время жизни [153]
    6.6. Ревербератор и сердечные аритмии. Уязвимость сердечной ткани [157]
  Глава седьмая. ЭХО — ИСТОЧНИК КОНЦЕНТРИЧЕСКИХ ВОЛН В ВОЗБУДИМЫХ СРЕДАХ [160]
    7.1. Эхо в простейших моделях. Источник эха и ревербератор [161]
    7.2. Источник эха в моделях, описываемых обыкновенными дифференциальными уравнениями [166]
    7.3. Эхо в непрерывных возбудимых средах [169]
    7.4. Эхо в модели клеток сердца. Уязвимость [172]
  Глава восьмая. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ИСТОЧНИКОВ ВОЛН АВТОВОЛНОВЫЕ ПРОЦЕССЫ И СЕРДЕЧНЫЕ АРИТМИИ [175]
    8.1. Фибрилляция сердечной мышцы [175]
    8.2. Синхронизация при взаимодействии источников волн [177]
    8.3. Размножение ревербераторов и фибрилляция [178]
    8.4. Взаимодействие источников эха [181]
    8.5. Связь параметров возбудимых сред с характеристиками дифференциального уравнения мембраны [185]
    8.6. Стационарные и нестационарные режимы распространения [190]
    8.7. Результаты микроэлектродного исследования уязвимости [194]
    8.8. О параметрах, контролирующих уязвимость в математических моделях и в миокарде [196]
    8.9. Следствия из моделей для антиаритмических веществ [198]
4. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ СТРУКТУР
  Глава девятая. МОДЕЛИРОВАНИЕ ОБЪЕМНЫХ КЛЕТОЧНЫХ СТРУКТУР ВИРУСЫ, ФЕРМЕНТЫ [202]
    9.1. Процесс формирования изображений [202]
    9.2. Математические основы объемной реконструкции [207]
    9.3. Модель трехмерной структуры отростка бактериофага [216]
    9.4. Голографический синтез объемного изображения поверхности клеточной мембраны [226]
    9.5. Моделирование структуры биологических макромолекул [232]
  Глава десятая. АНАЛИЗ КЛЕТОЧНЫХ СТРУКТУР ПО ИХ ИЗОБРАЖЕНИЯМ ГЛИЯ - СОСУДЫ, ХРОМОСОМЫ [238]
    10.1. Преобразование изображений клеток в цифровую форму [238]
    10.2. Определение морфометрических параметров клеток и клеточных структур [243]
    10.3. Исследование глиально-сосудистой системы головного мозга [255]
    10.4. Модель сокращения длины хромосом в митозе [261]
  Глава одиннадцатая. ВОССТАНОВЛЕНИЕ ЛИНЕЙНОЙ СТРУКТУРЫ БИОПОЛИМЕРОВ [266]
    11.1 Анализ первичной последовательности нуклеиновых кислот [266]
    11.2. Математическая постановка проблемы [268]
    11.3. Восстановление слов по составу второго ранга [273]
    11.4. Метод подстановки при восстановлении слов [274]
    11.5. Оптимизация биохимического эксперимента [277]
ЛИТЕРАТУРА [280]
ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ [301]
Формат: djvu
Размер:2886736 байт
Язык:РУС
Рейтинг: 141 Рейтинг
Открыть: Ссылка (RU)