Генетика вирусов гриппа
Автор(ы): | Пейлиз П., Кингсбери Д. У.
06.10.2007
|
Год изд.: | 1986 |
Описание: | В монографии рассмотрены генетика и молекулярные основы продукции вируса гриппа, его эволюция и эпидемиология. Описаны геном вируса гриппа, транскрипция генома и геномные РНК-сегменты. Представлены данные об антигенной вариации и мутантах вируса гриппа, экспрессии клонированных генов, генетическом базисе вирулентности вируса. Для микробиологов, вирусологов, генетиков. |
Оглавление: |
Обложка книги.
1. Перспективы развития генетики вируса гриппа. — Э. Кильбурн (Е. Kilbourne) [11]I. Введение [11] II. Развитие современной генетики вируса гриппа [12] A. Первые лабораторные доказательства генетической изменчивости [12] Б. Применение традиционных генетических методов для изучения вируса гриппа [13] B. Генетические маркеры [14] Г. Развитие методов бляшек [15] Д. Использование условных летальных мутантов [16] Е. Новые подходы в генетике вируса гриппа [17] 1. Биохимическая идентификация продуктов вирусного гена при нечетком определении вирусного потомства [17] 2. Картирование генома вируса гриппа коррелятивными физико-химическими и биологическими методами [18] 3. Применение методов молекулярной биологии для изучения вирусных генетических изменений [19] 4. Олигонуклеотидное картирование вирусных РНК [19] 5. Роль секвенирования белка и РНК в генетике вируса гриппа — внутригенное картирование [20] III. Вирусная генетика и понимание вирулентности и патогенности вирусов [20] IV. Взаимосвязь генетики вируса гриппа с эпидемиологией и эволюцией вирусов гриппа (молекулярная эпидемиология) [21] A. Генетическое перераспределение в природе и его роль в эволюции новых вирусов [22] Б. Генетика минорной изменчивости [23] B. Вирусы гриппа А, В и С [23] V. Практическое применение генетики вируса гриппа [24] VI. Специальная генетика вирусов с раздробленным геномом в связи с проблемами гриппа [25] VII. Нерешенные проблемы гриппа и генетические подходы к их решению [26] Список литературы [27] 2. Сегменты РНК вируса гриппа и кодированные ими белки.— Р. Лемб (R. Lamb) [31] I. Введение [31] II. Частица вируса гриппа: основная структура [31] III. Структура генома [33] А. Первые доказательства сегментированности генома [34] Б. Восемь сегментов РНК вируса гриппа [34] В. Методы определения функций гена [36] Г. Последовательности 5'- и З'-концов каждого сегмента РНК — общие [37] Д. Синтез двунитчатой ДНК с РНК вируса гриппа, клонирование и определение нуклеотидных последовательностей [39] IV Сегменты РНК вируса гриппа [42] A. Сегменты 1, 2 и 3 РНК: свойства белков FBI, PB2 и РА, ассоциированных с транскриптазой [42] Б. Сегмент 4 РНК: структура и функция гемагглютинина [43] 1. Структура сегмента 4 РНК, кодирующего гемагглютинин [44] 2. Трехмерная структура гемагглютинина [46] 3. Синтез гемагглютинина, котрансляционные и посттрансляционные модификации [47] 4. Активация инфекционности кливеджем и слияние in vitro [48] B. Сегмент 5 РНК: структура белка нуклеокапсида [48] Г. Сегмент 6 РНК: структура и свойства нейраминидазы [49] Д. Сегмент 7 РНК: структура и синтез мембранного белка (M1) и неструктурного белка (М2) [52] Е. Сегмент 8 РНК: структура и синтез неструктурных белков NS1 и NS2 [55] Ж. Перекрывающиеся кодирующие области, использующие различные рамки считывания у вирусов [58] Список литературы [58] 3. Транскрипция и репликация вируса гриппа. — Р. Краг (R. Krug) [66] I. Введение [66] II. Синтез вирусных мРНК [67] A. Праймирование клеточными кэппированными РНК—открытие [67] Б. Праймирование клеточными кэппированными РНК—механизм [69] B. Роль трех вирусных белков Р на этапах праймирования транскрипции [72] Г. Окончание транскрипции и добавление поли (А) [77] Д. Регуляция синтеза вирусной мРНК в инфицированной клетке [78] Е. Клеточный сайт для синтеза вирусных мРНК [80] Ж. Роль других функций ядер клеток-хозяев в синтезе вирусной мРНК — сплайсирование и метилирование внутренних А-остатков [84] III. Синтез транскриптов во всю длину [90] IV. Синтез вРНК (репликация) [92] Список литературы [93] 4. Генетическое родство вирусов гриппа (РНК и белок). — К. Шолтиссек (С. Scholtissek) [96] I. Введение [96] II. Генетическое родство вирусных РНК [96] A. Различия в скоростях миграции As сегментов РНК, выявленные методом электрофореза в полиакриламидном геле (ПААГЭ) [96] Б. Молекулярная гибридизация [98] 1. Прямая, РНК-РНК-гибридизация [98] 2. Конкурентная гибридизация [101] 3. ДНК-РНК-гибридизация [102] 4. Анализ двухцепочечных обработанных нуклеазой S1 гибридных молекул методом ПААГЭ [102] B. Метод олигонуклеотидного фингерпринта [103] Г. Секвенирование сегментов РНК [105] 1. Секвенирование (?)Р-концевых меченых РНК частичным расщеплением нуклеазой [105] 2. Секвенирование З'-конца РНК с использованием дидеокси-метода [105] 3. Секвенирование полных сегментов РНК [107] а) Ген гемагглютинина [108] б) Ген нейраминидазы [110] в) Три гена белка Р [110] г) Ген нуклеопротеида [111] д) Ген мембранного белка [111] е) Ген неструктурного белка [113] III. Генетическое родство вирусных белков [114] A. Различия в скоростях миграции вирусных белков при ПААГЭ [114] Б. Триптическое пептидное картирование [115] B. Прямое Секвенирование [116] IV. Заключение [117] Список литературы [118] 5. Антигенные вариации среди вирусов гриппа типа А. Р. Вебстер, В. Лейеер, Г. Эйр (R. Webster, W. Laver, G. Air) [123] I. Введение [123] II. Исторические сведения [124] III. Номенклатура [124] IV. Химические и физические свойства антигенов [126] V. Гемагглютинин [128] A. Выделение и антигенные свойства гемагглютинина [129] Б. Изменение структуры и антигенности гемагглютинина при низких значениях рН [131] B. Антигенный дрейф гемагглютинина [132] Г. Использование моноклональных антител в анализе антигенного дрейфа [133] Д. Изменение последовательности гемагглютинина вариантов вируса гриппа, отобранных с моноклональными антителами [133] Е. Расположение антигенных сайтов в 3-D структуре гемагглютинина [136] Ж. Отбор антигенных вариантов секвенированием [138] 3. Антигенный дрейф гемагглютинина вируса гриппа типа А низших животных [140] VI. Нейраминидаза [141] A. Антигенные вариации в нейраминидазе [143] Б. Селекция вариантов нейраминидазы с моноклональными антителами [144] B. Антигенный дрейф в нейраминидазах вирусов гриппа типа А низших животных [146] Г. Механизм антигенного дрейфа [147] VII. Антигенный шифт [147] A. Выводы из анализа последовательностей [148] Б. Возможные механизмы шифтов в штаммах вируса гриппа человека [150] B. Антигенный шифт среди вирусов гриппа низших животных [151] VIII. Вариация в нуклеопротеиде [152] IX. Вариация в матриксном белке [153] X. Вариация в неструктурных белках [154] XI. Вариации в белках полимеразы [154] XII. Каково будущее? [155] Список литературы [157] 6. Экспрессия клонированных генов вируса гриппа. М. Дж. Гетсинг, Дж. Сэмбрук (M. J. Gething, J. Sambrook) [161] I. Введение [161] II. Векторы экспрессии [162] III. Экспрессия генов вируса гриппа в Е. coli [162] А. Экспрессия гемагглютинина [163] Б. Экспрессия белка NS1 [166] IV. Экспрессия генов вируса гриппа в клетках эукариотов [166] A. Экспрессия гемагглютинина в клетках обезьян с использованием рекомбинантных SV40 вирусных векторов [166] Б. Приготовление генов гемагглютинина [168] B. Конструирование рекомбинантных геномов [168] Г. Введение рекомбинантных геномов в клетки обезьян и продукция вирусного материала [170] Д. Анализ гемагглютинина экспрессированного из SV40-НА-рекомбинантных векторов [172] Е. Количественная оценка гемагглютинина, экспрессированного из рекомбинантных геномов [174] Ж. Влияние промежуточных последовательностей в транскрипте гемагглютинина рекомбинанта на уровень экспрессии белка гемагглютинина [175] 3. Экспрессия матриксного гена в клетках обезьян с использованием SV40-М-рекомбинантного вируса [176] И. Кратковременная экспрессия клонированных генов в клетках COS-1 [176] К. Непрерывная экспрессия гемагглютинина из генов, интегрированных в хромосомы клеток эукариотов [177] V. Анализ экспрессии белков мутанта гемагглютинина [179] А. Сигнал-минус гемагглютинина (S-HA) —негликозилированный внутриклеточный белок [179] Б. Удаление С-терминальной гидрофобной последовательности превращает гемагглютинин в секретированный белок [180] В. Планы на будущее [184] Список литературы [185] 7. Мутанты вируса гриппа. — Б. Мэйхи (В. Mahy) [186] I. Введение [186] II. Характеристика вирусных мутантов [187] A. Системы вирус гриппа—клетка [188] Б. Природа вирусной популяции [188] B. Скорость естественной мутации [189] Г. Индукция мутантов [190] 1. Мутагены [191] Д. Текучесть и реверсия [191] III. Температурочувствительные мутанты [194] A. Генетическое взаимодействие и классификация мутантов [194] Б. Передача ts-повреждений индивидуальным сегментам генома 196] 1. Мутанты из Кембриджа [197] 2. Мутанты из Нью-Йорка и Токио [198] 3. Мутанты из Гессена [198] 4. Мутанты из Москвы [199] 5. Мутанты из Бетезды [199] 6. Заключение [200] B. Фенотипический анализ температурочувствительных мутантов [200] 1. Предназначенность полипептидов относительно сегментов РНК [201] 2. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 1 РНК [202] а) Активность транскриптазы вирионной РНК [203] б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы экстрактов инфицированных клеток [205] в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [206] г) Синтез вирусспецифических полипептидов [210] д) Заключение [212] 3. Мутанты с повреждениями в сегменте 2 РНК [214] а) Активность вирионной транскриптазы [214] б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток [215] в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [216] г) Синтез вирусспецифических полипептидов [218] д) Заключение [218] 4. Мутанты с повреждениями в сегменте 3 РНК [219] а) Активность транскриптазы вириона [220] б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток [220] в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [220] г) Синтез вирусспецифических полипептидов [221] д) Заключение [222] 5. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 4 РНК [223] 6. Мутанты с ts-повреждениями в сегментах РНК, кодирующих нуклеопротеид [224] а) Активность транскриптазы РНК [224] б) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [225] в) Синтез вирусспецифических полипептидов [226] г) Заключение [226] 7. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте РНК, кодирующем нейраминидазу [227] 8. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 7 РНК [228] 9. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 8 РНК [230] Г. Вакцины, полученные на основе температурочувствительных мутантов [232] IV. Холодоадаптированные мутанты [233] V. Мутанты круга хозяев [235] A. Неусловные мутанты круга хозяев [235] Б. Условные мутанты круга хозяев [237] B. Заключение [238] VI. Мутанты, устойчивые к амантадину [238] VII. Общие заключения [239] Список литературы [241] 8. Структура дефектных интерферирующих РНК вируса гриппа и их прогениторных генов.—Д. Нейяк, Н. Сивесабраманъян (D. Nayak, N. Sivasubramanian) [249] I. Введение [249] II. Свойства ДИ частиц вируса гриппа [249] III. РНК ДИ частиц вируса гриппа [250] IV. Структура генов и белков полимеразы [252] A. Последовательность нуклеотидов генов полимеразы [252] Б. Первичная структура белков РВ1 и РВ2 [253] B. Предсказанные вторичные структуры белков РВ1 и РВ2 [255] V. Структура ДИ РНК [258] А. Классы ДИ РНК [258] Б. Полные последовательности нуклеотидов ДИ РНК [260] VI. Генерирование ДИ РНК из прогениторных РНК [261] VII. Транскрипция ДИ частиц вируса гриппа [266] VIII. Интерференция ДИ вирусами гриппа [268] IX. Заключение [269] Список литературы [269] 9. Вирусы гриппа В и гриппа С. Г. Эйр, Р. Компанс (G. Air, R. Compans) [272] I. Введение [272] II. Вирус гриппа В [272] А. Разновидность РНК вируса гриппа В [272] Б. Белки вируса гриппа В [274] 1. Гемагглютинин [276] 2. Нейраминидаза [277] 3. Матричный белок [279] 4. Неструктурные белки [281] 5. Белки Р [281] В. Репликация вируса гриппа В [281] Г. Эпидемиология [282] Д. Антигенная изменчивость вирусов гриппа В [283] III. Вирус гриппа С [285] A. Структура вируса [285] 1. Морфология вирионов [285] 2. Разновидности вирусной РНК [286] 3. Вирусные полипептиды [287] 4. Активности слияния и гемолиза [289] 5. Фермент, разрушающий рецептор [289] Б. Репликация вируса гриппа С [290] B. Генетика и эпидемиология [291] Список литературы [293] 10. Различия в патогенезе гриппозной инфекции, зависящие от вируса. Дж. Шульман (J. Schulman) [296] I. Введение [296] II. Методы [297] III. Различия биологических свойств, связанные с гемагглютинином [299] IV. Вирулентность для цыплят [301] V. Нейровирулентность для мышей [303] VI. Вирулентность для других экспериментальных животных [304] A. Хорьки [304] Б. Крысы [304] B. Мыши [305] VII. Вирусзависимые различия в других системах [307] A. Культуры клеток [307] Б. Выращивание вируса в эмбрионах [307] B. Чувствительность к амантадину [307] VIII. Вирулентность для человека [308] IX. Резюме [310] Список литературы [310] 11. Молекулярная эпидемиология вируса гриппа. П. Пейлиз, Дж.Юнг (P. Palese, J. Young) [313] I. Введение [313] II. Вирусы гриппа А, В и С и связанные с ними заболевания [313] III. Грипп в XX столетии [314] IV. Надзор за вирусами гриппа [316] V. Вирусы H1N1, появившиеся в 1977г. [317] VI. Молекулярная эпидемиология гриппа у животных [318] VII. Механизмы, влияющие на изменчивость полевых штаммов вирусов гриппа [319] A. Точечные мутации [320] Б. Рекомбинация [323] B. Делеции/вставки [325] Г. Повторное появление старых генов [326] VIII. Перспективы на будущее [326] Список литературы [327] Предметный указатель [329] |
Формат: | djvu |
Размер: | 5030712 байт |
Язык: | RUS |
Рейтинг: | 184 |
Открыть: | Ссылка (RU) |